1，定位不同
公众号的作用更多是文章营销和品牌传播，它服务于信息、内容。而小程序侧重于产品与服务,服务的最终端的消费者和用户，所以特别符合线下场景。
2，功能不同
小程序相比公众号而言运行更流畅，能够提供更加复杂的产品，同时可以嵌入更多的模块和应用，服务的范围更加宽广。
3，体验不同
公众号微商城h5操作延时较大，小程序体验接近原生 App，体验非常流畅和舒服。
4，运营方式不同
微信公众号是基于粉丝运营的，需要长期更新原创文章或组建活动吸引用户的关注。这些流量并不稳定，绝大部分用户最终都成为了僵尸粉，不能有效转化。而小程序则是基于用户的当次消费使用，即用即走，非常方便。跟微信公众号相比，小程序的运营简单许多。